1- Theo quy định tại Khoản 3 Điều 14 Thông tư Liên tịch số 12/2016/TTLT-BKHCN-BTC ngày 28/6/2016 của Liên Bộ Khoa học và Công nghệ và Bộ Tài chính hướng dẫn về nội dung chi và quản lý Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của doanh nghiệp thì:

Trong thời hạn 05 năm, kể từ khi trích lập, tổng số tiền đã sử dụng và số tiền nộp về Quỹ phát triển khoa học và công nghệ quốc gia hoặc Quỹ phát triển khoa học và công nghệ của các bộ chủ quản, tỉnh, thành phố nơi doanh nghiệp đăng ký nộp thuế không hết 70% số quỹ đã trích lập kể cả nhận Điều chuyển (nếu có) thì doanh nghiệp phải nộp NSNN phần thuế TNDN tính trên số tiền Quỹ còn lại và phần lãi phát sinh từ số thuế TNDN đó.

2- Căn cứ văn bản số 5874/TCT-DNL ngày 22/12/2017 của Tổng Cục Thuế về kê khai nộp thuế TNDN

Trường hợp doanh nghiệp hoàn nhập quỹ phát triển khoa học và công nghệ đã trích chưa sử dụng trong thời gian 5 năm kể từ khi trích lập thì không phải nộp tiền lãi tương ứng số thuế TNDN phát sinh do hoàn nhập quỹ khoa học công nghệ.